Dalam upaya mengimplementasikan visi sekolah, SDN Bubutan IV Surabaya menjabarkan misi sekolah sebagai berikut :
Menyiapkan generasi unggul yang memiliki akhlak mulia.
Menyiapkan generasi yang memiliki potensi di bidang IPTEK.
Mewujudkan Gerakan Literasi Sekolah.
Meningkatkan prestasi siswa di bidang akademik dan non akademik.
Menciptakan sekolah ramah anak dengan generasi yang memiliki sikap yang tercermin dalam profil pelajar pancasila.
Menumbuhkembangkan budaya warga sekolah dalam upaya perlindungan lingkungan.
Menumbuhkembangkan budaya warga sekolah dalam upaya pelestarian lingkungan.
Menumbuhkembangkan budaya warga sekolah dalam upaya pencegahan kerusakan dan pencemaran lingkungan